9月16日0时至24时，全国31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例140例。其中输入性病例64例(广东15例、福建12例、上海9例、北京7例、云南5例、黑龙江3例、江苏3例、天津2例、内蒙古2例、辽宁2例、四川2例、湖南1例、重庆1例)，其中无症状感染者8例(广东4例、北京1例、 辽宁1例，湖南1例)本地病例76例(四川34例，西藏10例，贵州8例，天津5例，广西4例，内蒙古3例，广东3例，山东2例，海南2例，重庆2例，云南1例，陕西1例，新疆1例)，其中已由无症状感染转为确诊病例17例(四川15例，西藏1例，新疆1例)。 没有新的死亡病例。没有新的疑似病例。
当日新增治愈出院病例298例，其中输入性病例43例，本地病例255例(四川74例、海南52例、广东39例、西藏25例、内蒙古18例、黑龙江13例、天津6例、山东5例、贵州3例、新疆3例、北京2例、山西2例、上海2例、浙江2例、福建2例)
国外确诊病例586例(无重症)，无现有疑似病例。确诊病例23333例，治愈病例22747例，无死亡病例。
截至9月16日24时，据31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告，累计确诊病例4088例(其中重症38例)，治愈出院病例238711例，死亡5226例，确诊病例248025例，无现有疑似病例。共追踪密切接触者5803176人，仍在医学观察的密切接触者202221人。
31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染病例578例，其中输入性病例73例，本地病例505例(贵州146例，四川87例，西藏56例，广西45例，天津40例，山东30例，湖北25例，新疆23例，甘肃14例，内蒙古9例，江西9例，全国9例)。
当日解除医学观察的无症状感染者1137人，其中输入性病例68例，本地病例1069例(西藏379例，黑龙江135例，辽宁64例，新疆56例，山东53例，青海53例，海南51例，四川47例，河南31例，内蒙古29例，湖北29例，广西28例，广东25例)，当日确诊病例25例(境外输入8例)；接受医学观察的无症状感染者18，865人(717人从国外输入)。
累计接收港澳台确诊病例6297209例。其中，香港特别行政区405061例(出院80219例，死亡9852例)，澳门特别行政区793例(出院787例，死亡6例)，台湾省5891355例(出院13742例，死亡10469例)。
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